Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDZRN3Q9UPQ7 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms