Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCDHA12Q9UN75 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHA12Q9UN75 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms