Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
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USP18Q9UMW8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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USP18Q9UMW8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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USP18Q9UMW8 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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USP18Q9UMW8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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USP18Q9UMW8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
USP18Q9UMW8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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