Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLEC4AQ9UMR7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLEC4AQ9UMR7 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLEC4AQ9UMR7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLEC4AQ9UMR7 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLEC4AQ9UMR7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLEC4AQ9UMR7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLEC4AQ9UMR7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLEC4AQ9UMR7 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLEC4AQ9UMR7 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLEC4AQ9UMR7 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLEC4AQ9UMR7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLEC4AQ9UMR7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLEC4AQ9UMR7 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLEC4AQ9UMR7 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLEC4AQ9UMR7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLEC4AQ9UMR7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CLEC4AQ9UMR7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CLEC4AQ9UMR7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLEC4AQ9UMR7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLEC4AQ9UMR7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLEC4AQ9UMR7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLEC4AQ9UMR7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLEC4AQ9UMR7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLEC4AQ9UMR7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLEC4AQ9UMR7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLEC4AQ9UMR7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLEC4AQ9UMR7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLEC4AQ9UMR7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLEC4AQ9UMR7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLEC4AQ9UMR7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLEC4AQ9UMR7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLEC4AQ9UMR7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLEC4AQ9UMR7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLEC4AQ9UMR7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLEC4AQ9UMR7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLEC4AQ9UMR7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLEC4AQ9UMR7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLEC4AQ9UMR7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLEC4AQ9UMR7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLEC4AQ9UMR7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLEC4AQ9UMR7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLEC4AQ9UMR7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLEC4AQ9UMR7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLEC4AQ9UMR7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLEC4AQ9UMR7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLEC4AQ9UMR7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CLEC4AQ9UMR7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLEC4AQ9UMR7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLEC4AQ9UMR7 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLEC4AQ9UMR7 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLEC4AQ9UMR7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CLEC4AQ9UMR7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms