Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PALD1Q9ULE6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PALD1Q9ULE6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PALD1Q9ULE6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PALD1Q9ULE6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PALD1Q9ULE6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PALD1Q9ULE6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PALD1Q9ULE6 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PALD1Q9ULE6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PALD1Q9ULE6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PALD1Q9ULE6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PALD1Q9ULE6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PALD1Q9ULE6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PALD1Q9ULE6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PALD1Q9ULE6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PALD1Q9ULE6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PALD1Q9ULE6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PALD1Q9ULE6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PALD1Q9ULE6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PALD1Q9ULE6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PALD1Q9ULE6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PALD1Q9ULE6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PALD1Q9ULE6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PALD1Q9ULE6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PALD1Q9ULE6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PALD1Q9ULE6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PALD1Q9ULE6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PALD1Q9ULE6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PALD1Q9ULE6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PALD1Q9ULE6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PALD1Q9ULE6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PALD1Q9ULE6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PALD1Q9ULE6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms