Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX3

MYH13, Myosin-13, humanhuman

Predictions only

Length 1,938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH13Q9UKX3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYH13Q9UKX3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms