Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJD2Q9UKL4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJD2Q9UKL4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms