Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PARP4Q9UKK3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PARP4Q9UKK3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms