Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV9

DDX41, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX41, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX41Q9UJV9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX41Q9UJV9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX41Q9UJV9 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX41Q9UJV9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX41Q9UJV9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX41Q9UJV9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX41Q9UJV9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX41Q9UJV9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX41Q9UJV9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX41Q9UJV9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX41Q9UJV9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX41Q9UJV9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX41Q9UJV9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX41Q9UJV9 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX41Q9UJV9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX41Q9UJV9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX41Q9UJV9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX41Q9UJV9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX41Q9UJV9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX41Q9UJV9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX41Q9UJV9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX41Q9UJV9 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX41Q9UJV9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX41Q9UJV9 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX41Q9UJV9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX41Q9UJV9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX41Q9UJV9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX41Q9UJV9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX41Q9UJV9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX41Q9UJV9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX41Q9UJV9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX41Q9UJV9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX41Q9UJV9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX41Q9UJV9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX41Q9UJV9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX41Q9UJV9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX41Q9UJV9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX41Q9UJV9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX41Q9UJV9 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX41Q9UJV9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX41Q9UJV9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX41Q9UJV9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX41Q9UJV9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX41Q9UJV9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX41Q9UJV9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX41Q9UJV9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX41Q9UJV9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX41Q9UJV9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX41Q9UJV9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX41Q9UJV9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX41Q9UJV9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX41Q9UJV9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX41Q9UJV9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX41Q9UJV9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX41Q9UJV9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX41Q9UJV9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX41Q9UJV9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX41Q9UJV9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX41Q9UJV9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DDX41Q9UJV9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DDX41Q9UJV9 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DDX41Q9UJV9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DDX41Q9UJV9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DDX41Q9UJV9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DDX41Q9UJV9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DDX41Q9UJV9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DDX41Q9UJV9 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX41Q9UJV9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX41Q9UJV9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX41Q9UJV9 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX41Q9UJV9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX41Q9UJV9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX41Q9UJV9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX41Q9UJV9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX41Q9UJV9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX41Q9UJV9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX41Q9UJV9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX41Q9UJV9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX41Q9UJV9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX41Q9UJV9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX41Q9UJV9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX41Q9UJV9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX41Q9UJV9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX41Q9UJV9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX41Q9UJV9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX41Q9UJV9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX41Q9UJV9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX41Q9UJV9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX41Q9UJV9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX41Q9UJV9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX41Q9UJV9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX41Q9UJV9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX41Q9UJV9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX41Q9UJV9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX41Q9UJV9 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX41Q9UJV9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX41Q9UJV9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX41Q9UJV9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX41Q9UJV9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX41Q9UJV9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms