Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PLXNA1Q9UIW2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PLXNA1Q9UIW2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms