Protein–RNA interactions for Protein: Q9UID6

ZNF639, Zinc finger protein 639, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF639Q9UID6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF639Q9UID6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZNF639Q9UID6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZNF639Q9UID6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF639Q9UID6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF639Q9UID6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF639Q9UID6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF639Q9UID6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF639Q9UID6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF639Q9UID6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF639Q9UID6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms