Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C9orf78Q9NZ63 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C9orf78Q9NZ63 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C9orf78Q9NZ63 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
C9orf78Q9NZ63 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C9orf78Q9NZ63 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C9orf78Q9NZ63 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C9orf78Q9NZ63 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C9orf78Q9NZ63 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
C9orf78Q9NZ63 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C9orf78Q9NZ63 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C9orf78Q9NZ63 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C9orf78Q9NZ63 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C9orf78Q9NZ63 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C9orf78Q9NZ63 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C9orf78Q9NZ63 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C9orf78Q9NZ63 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C9orf78Q9NZ63 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C9orf78Q9NZ63 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C9orf78Q9NZ63 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C9orf78Q9NZ63 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C9orf78Q9NZ63 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C9orf78Q9NZ63 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
C9orf78Q9NZ63 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
C9orf78Q9NZ63 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C9orf78Q9NZ63 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
C9orf78Q9NZ63 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C9orf78Q9NZ63 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C9orf78Q9NZ63 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C9orf78Q9NZ63 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C9orf78Q9NZ63 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C9orf78Q9NZ63 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C9orf78Q9NZ63 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C9orf78Q9NZ63 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C9orf78Q9NZ63 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C9orf78Q9NZ63 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C9orf78Q9NZ63 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C9orf78Q9NZ63 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C9orf78Q9NZ63 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C9orf78Q9NZ63 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C9orf78Q9NZ63 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C9orf78Q9NZ63 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C9orf78Q9NZ63 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C9orf78Q9NZ63 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C9orf78Q9NZ63 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C9orf78Q9NZ63 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C9orf78Q9NZ63 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C9orf78Q9NZ63 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C9orf78Q9NZ63 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C9orf78Q9NZ63 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C9orf78Q9NZ63 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C9orf78Q9NZ63 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C9orf78Q9NZ63 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C9orf78Q9NZ63 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
C9orf78Q9NZ63 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C9orf78Q9NZ63 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C9orf78Q9NZ63 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C9orf78Q9NZ63 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C9orf78Q9NZ63 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C9orf78Q9NZ63 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
C9orf78Q9NZ63 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C9orf78Q9NZ63 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C9orf78Q9NZ63 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C9orf78Q9NZ63 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C9orf78Q9NZ63 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C9orf78Q9NZ63 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
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