Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms