Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX00

TMEM160, Transmembrane protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM160Q9NX00 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM160Q9NX00 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms