Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
IFT57Q9NWB7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFT57Q9NWB7 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms