Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPTLC3Q9NUV7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms