Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms