Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOMER3Q9NSC5 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HOMER3Q9NSC5 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms