Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LTBP3Q9NS15 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
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