Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FANCFQ9NPI8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms