Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP58

ABCB6, ATP-binding cassette sub-family B member 6, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB6Q9NP58 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCB6Q9NP58 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCB6Q9NP58 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCB6Q9NP58 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCB6Q9NP58 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCB6Q9NP58 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCB6Q9NP58 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCB6Q9NP58 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCB6Q9NP58 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCB6Q9NP58 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCB6Q9NP58 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCB6Q9NP58 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCB6Q9NP58 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCB6Q9NP58 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms