Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KIAA1549Q9HCM3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms