Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
LY9Q9HBG7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms