Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6T3

RPAP3, RNA polymerase II-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP3Q9H6T3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPAP3Q9H6T3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms