Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1DQ9H5J8 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms