Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E7

USP44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP44Q9H0E7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP44Q9H0E7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms