Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BHLHE41Q9C0J9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms