Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AMBRA1Q9C0C7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms