Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR8

KRTAP3-1, Keratin-associated protein 3-1, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP3-1Q9BYR8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP3-1Q9BYR8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms