Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIFKQ9BYG3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NIFKQ9BYG3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms