Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRIP1Q9BX63 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms