Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NDC1Q9BTX1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NDC1Q9BTX1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NDC1Q9BTX1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NDC1Q9BTX1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NDC1Q9BTX1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NDC1Q9BTX1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NDC1Q9BTX1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NDC1Q9BTX1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NDC1Q9BTX1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NDC1Q9BTX1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NDC1Q9BTX1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NDC1Q9BTX1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NDC1Q9BTX1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NDC1Q9BTX1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NDC1Q9BTX1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NDC1Q9BTX1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NDC1Q9BTX1 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NDC1Q9BTX1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NDC1Q9BTX1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NDC1Q9BTX1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NDC1Q9BTX1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NDC1Q9BTX1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NDC1Q9BTX1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NDC1Q9BTX1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NDC1Q9BTX1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NDC1Q9BTX1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NDC1Q9BTX1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NDC1Q9BTX1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NDC1Q9BTX1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NDC1Q9BTX1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NDC1Q9BTX1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NDC1Q9BTX1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NDC1Q9BTX1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NDC1Q9BTX1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NDC1Q9BTX1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NDC1Q9BTX1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NDC1Q9BTX1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NDC1Q9BTX1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NDC1Q9BTX1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NDC1Q9BTX1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NDC1Q9BTX1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NDC1Q9BTX1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NDC1Q9BTX1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NDC1Q9BTX1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms