Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSM1

PCGF1, Polycomb group RING finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF1Q9BSM1 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCGF1Q9BSM1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms