Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIOK1Q9BRS2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms