Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EBF4Q9BQW3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms