Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms