Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms