Protein–RNA interactions for Protein: Q99616

CCL13, C-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL13Q99616 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL13Q99616 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL13Q99616 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms