Protein–RNA interactions for Protein: Q99613

EIF3C, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CQ99613 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
EIF3CQ99613 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF3CQ99613 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF3CQ99613 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF3CQ99613 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF3CQ99613 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF3CQ99613 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF3CQ99613 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF3CQ99613 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF3CQ99613 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF3CQ99613 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF3CQ99613 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF3CQ99613 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF3CQ99613 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF3CQ99613 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF3CQ99613 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF3CQ99613 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF3CQ99613 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF3CQ99613 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF3CQ99613 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF3CQ99613 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF3CQ99613 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF3CQ99613 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF3CQ99613 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF3CQ99613 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF3CQ99613 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF3CQ99613 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF3CQ99613 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF3CQ99613 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF3CQ99613 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF3CQ99613 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF3CQ99613 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF3CQ99613 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF3CQ99613 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF3CQ99613 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF3CQ99613 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF3CQ99613 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF3CQ99613 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF3CQ99613 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF3CQ99613 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF3CQ99613 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF3CQ99613 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF3CQ99613 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF3CQ99613 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF3CQ99613 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF3CQ99613 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF3CQ99613 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF3CQ99613 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF3CQ99613 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF3CQ99613 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF3CQ99613 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF3CQ99613 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EIF3CQ99613 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms