Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms