Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CSRNP1Q96S65 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms