Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CITED4Q96RK1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms