Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms