Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGBD1Q96JS3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms