Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC9

EAF1, ELL-associated factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF1Q96JC9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms