Protein–RNA interactions for Protein: Q96IS3

RAX2, Retina and anterior neural fold homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAX2Q96IS3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms