Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LTV1Q96GA3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms