Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms