Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MALSU1Q96EH3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms