Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms